K izolaci potrubí se obvykle používají rohože z minerální vlny o tloušťce 20 mm, na vnější straně potažené hliníkovou fólií (zabraňující roztržení a poprášení izolace). Vlna by měla být umístěna na všechny prvky systému, tj. Nejen na rovné části, ale také na všechny armatury a svorky (s jejich pomocí jsou kanály připevněny ke stěnám).
Varování! Kvůli nižším nákladům mají některé domy mechanický ventilační systém z pružných hliníkových pružných trubek, které jsou již z výroby izolovány. Někteří odborníci toto řešení nedoporučují, protože se domnívají, že čištění těchto trubek je nemožné.
